Mae canser y pancreas yn un o'r tiwmorau mwyaf marwol yn y byd gyda prognosis gwael. Felly, mae angen model rhagfynegi cywir i nodi cleifion sydd mewn perygl uchel o ganser y pancreas er mwyn teilwra triniaeth a gwella prognosis y cleifion hyn.
Fe wnaethom gael data RNAseq adenocarsinoma pancreatig (PAAD) The Cancer Genome Atlas (TCGA) o gronfa ddata UCSC Xena, nodi lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwnedd (irlncRNAs) trwy ddadansoddiad cydberthynas, a nodi gwahaniaethau rhwng TCGA a meinweoedd adenocarsinoma pancreatig arferol. DEirlncRNA) o TCGA a mynegiant meinwe genoteip (GTEx) meinwe pancreatig. Perfformiwyd dadansoddiadau atchweliad unnewidyn ac lasso pellach i lunio modelau llofnod prognostig. Yna fe wnaethom gyfrifo'r arwynebedd o dan y gromlin a phennu'r gwerth torbwynt gorau posibl ar gyfer nodi cleifion ag adenocarsinoma pancreatig risg uchel ac isel. I gymharu nodweddion clinigol, treiddiad celloedd imiwnedd, microamgylchedd imiwnosuppressive, a gwrthwynebiad cemotherapi mewn cleifion â chanser pancreatig risg uchel ac isel.
Fe wnaethom nodi 20 pâr o DEirlncRNA a grwpio cleifion yn ôl y gwerth torbwynt gorau posibl. Dangosom fod gan ein model llofnod prognostig berfformiad sylweddol wrth ragweld prognosis cleifion â PAAD. Mae AUC y gromlin ROC yn 0.905 ar gyfer y rhagolwg 1 flwyddyn, 0.942 ar gyfer y rhagolwg 2 flynedd, a 0.966 ar gyfer y rhagolwg 3 blynedd. Roedd gan gleifion risg uchel gyfraddau goroesi is a nodweddion clinigol gwaeth. Dangosom hefyd fod cleifion risg uchel wedi'u himiwnosupresi a gallant ddatblygu ymwrthedd i imiwnotherapi. Gall gwerthuso cyffuriau gwrthganser fel paclitaxel, sorafenib, ac erlotinib yn seiliedig ar offer rhagfynegi cyfrifiadurol fod yn briodol ar gyfer cleifion risg uchel â PAAD.
At ei gilydd, sefydlodd ein hastudiaeth fodel risg prognostig newydd yn seiliedig ar irlncRNA wedi'i baru, a ddangosodd werth prognostig addawol mewn cleifion â chanser y pancreas. Gall ein model risg prognostig helpu i wahaniaethu cleifion â PAAD sy'n addas ar gyfer triniaeth feddygol.
Mae canser y pancreas yn diwmor malaen gyda chyfradd goroesi isel am bum mlynedd a gradd uchel. Ar adeg y diagnosis, mae'r rhan fwyaf o gleifion eisoes mewn camau datblygedig. Yng nghyd-destun epidemig COVID-19, mae meddygon a nyrsys dan bwysau enfawr wrth drin cleifion â chanser y pancreas, ac mae teuluoedd cleifion hefyd yn wynebu pwysau lluosog wrth wneud penderfyniadau triniaeth [1, 2]. Er bod datblygiadau mawr wedi'u gwneud wrth drin DOADs, megis therapi neoadjuvant, echdoriad llawfeddygol, therapi ymbelydredd, cemotherapi, therapi moleciwlaidd wedi'i dargedu, ac atalyddion pwynt gwirio imiwnedd (ICIs), dim ond tua 9% o gleifion sy'n goroesi pum mlynedd ar ôl diagnosis [3], 4]. Gan fod symptomau cynnar adenocarsinoma pancreatig yn annodweddiadol, fel arfer caiff cleifion eu diagnosio â metastasisau mewn cam datblygedig [5]. Felly, ar gyfer claf penodol, rhaid i driniaeth gynhwysfawr unigoledig bwyso a mesur manteision ac anfanteision pob opsiwn triniaeth, nid yn unig i ymestyn goroesiad, ond hefyd i wella ansawdd bywyd [6]. Felly, mae angen model rhagfynegi effeithiol i asesu prognosis claf yn gywir [7]. Felly, gellir dewis triniaeth briodol i gydbwyso goroesiad ac ansawdd bywyd cleifion â PAAD.
Mae prognosis gwael PAAD yn bennaf oherwydd ymwrthedd i gyffuriau cemotherapi. Yn ystod y blynyddoedd diwethaf, mae atalyddion pwynt gwirio imiwnedd wedi cael eu defnyddio'n helaeth wrth drin tiwmorau solet [8]. Fodd bynnag, anaml y mae defnyddio ICIs mewn canser y pancreas yn llwyddiannus [9]. Felly, mae'n bwysig nodi cleifion a allai elwa o therapi ICI.
Mae RNA hir nad yw'n codio (lncRNA) yn fath o RNA nad yw'n codio gyda thrawsgrifiadau >200 niwcleotid. Mae lncRNAs yn gyffredin ac yn ffurfio tua 80% o'r trawsgrifiadom dynol [10]. Mae corff mawr o waith wedi dangos y gall modelau prognostig sy'n seiliedig ar lncRNA ragweld prognosis cleifion yn effeithiol [11, 12]. Er enghraifft, nodwyd 18 o lncRNAs sy'n gysylltiedig ag awtoffagi i gynhyrchu llofnodion prognostig mewn canser y fron [13]. Defnyddiwyd chwech o lncRNAs eraill sy'n gysylltiedig ag imiwnedd i sefydlu nodweddion prognostig glioma [14].
Mewn canser y pancreas, mae rhai astudiaethau wedi sefydlu llofnodion sy'n seiliedig ar lncRNA i ragweld prognosis cleifion. Sefydlwyd llofnod 3-lncRNA mewn adenocarsinoma pancreatig gydag arwynebedd o dan y gromlin ROC (AUC) o ddim ond 0.742 a goroesiad cyffredinol (OS) o 3 blynedd [15]. Yn ogystal, mae gwerthoedd mynegiant lncRNA yn amrywio ymhlith gwahanol genomau, gwahanol fformatau data, a gwahanol gleifion, ac mae perfformiad y model rhagfynegol yn ansefydlog. Felly, rydym yn defnyddio algorithm modelu newydd, paru ac iteriad, i gynhyrchu llofnodion lncRNA sy'n gysylltiedig ag imiwnedd (irlncRNA) i greu model rhagfynegol mwy cywir a sefydlog [8].
Cafwyd data RNAseq wedi'i normaleiddio (FPKM) a data mynegiant meinwe genoteip a TCGA canser y pancreas clinigol (GTEx) o gronfa ddata UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/). Cafwyd ffeiliau GTF o gronfa ddata Ensembl (http://asia.ensembl.org) a'u defnyddio i echdynnu proffiliau mynegiant lncRNA o RNAseq. Lawrlwythwyd genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd o gronfa ddata ImmPort (http://www.immport.org) ac fe wnaethom nodi lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwnedd (irlncRNAs) gan ddefnyddio dadansoddiad cydberthynas (p < 0.001, r > 0.4). Nodwyd irlncRNAs a fynegir yn wahaniaethol (DEirlncRNAs) trwy groesi irlncRNAs ac lncRNAs a fynegir yn wahanol a gafwyd o gronfa ddata GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) yn y garfan TCGA-PAAD (|logFC| > 1 ac FDR) <0.05).
Mae'r dull hwn wedi cael ei adrodd o'r blaen [8]. Yn benodol, rydym yn llunio X i gymryd lle'r pâr o lncRNA A ac lncRNA B. Pan fydd gwerth mynegiant lncRNA A yn uwch na gwerth mynegiant lncRNA B, diffinnir X fel 1, fel arall diffinnir X fel 0. Felly, gallwn gael matrics o 0 neu – 1. Mae echelin fertigol y matrics yn cynrychioli pob sampl, ac mae'r echelin lorweddol yn cynrychioli pob pâr DEirlncRNA gyda gwerth o 0 neu 1.
Defnyddiwyd dadansoddiad atchweliad unnewidyn ac yna atchweliad Lasso i sgrinio parau DEirlncRNA prognostig. Defnyddiodd y dadansoddiad atchweliad lasso groes-ddilysu 10 plyg a ailadroddwyd 1000 o weithiau (p < 0.05), gyda 1000 o ysgogiadau ar hap fesul rhediad. Pan oedd amlder pob pâr DEirlncRNA yn fwy na 100 gwaith mewn 1000 o gylchoedd, dewiswyd parau DEirlncRNA i lunio model risg prognostig. Yna defnyddiwyd y gromlin AUC i ddod o hyd i'r gwerth torbwynt gorau posibl ar gyfer dosbarthu cleifion PAAD yn grwpiau risg uchel ac isel. Cyfrifwyd gwerth AUC pob model hefyd a'i blotio fel cromlin. Os yw'r gromlin yn cyrraedd y pwynt uchaf sy'n nodi'r gwerth AUC mwyaf, mae'r broses gyfrifo yn dod i ben ac ystyrir mai'r model yw'r ymgeisydd gorau. Adeiladwyd modelau cromlin ROC 1-, 3- a 5-mlynedd. Defnyddiwyd dadansoddiadau atchweliad unnewidyn ac aml-newidyn i archwilio perfformiad rhagfynegol annibynnol y model risg prognostig.
Defnyddiwch saith offeryn i astudio cyfraddau ymdreiddiad celloedd imiwnedd, gan gynnwys XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, a CIBERSORT. Lawrlwythwyd data ymdreiddiad celloedd imiwnedd o gronfa ddata TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Dadansoddwyd y gwahaniaeth yng nghynnwys celloedd sy'n ymdreiddiad i'r system imiwnedd rhwng y grwpiau risg uchel ac isel yn y model a adeiladwyd gan ddefnyddio prawf rheng wedi'i lofnodi Wilcoxon, a dangosir y canlyniadau yn y graff sgwâr. Perfformiwyd dadansoddiad cydberthynas Spearman i ddadansoddi'r berthynas rhwng gwerthoedd sgôr risg a chelloedd sy'n ymdreiddiad i'r system imiwnedd. Dangosir y cyfernod cydberthynas canlyniadol fel lolipop. Gosodwyd y trothwy arwyddocâd ar p < 0.05. Perfformiwyd y weithdrefn gan ddefnyddio'r pecyn R ggplot2. I archwilio'r berthynas rhwng y model a lefelau mynegiant genynnau sy'n gysylltiedig â chyfradd ymdreiddiad celloedd imiwnedd, gwnaethom berfformio'r pecyn ggstatsplot a delweddu plot ffidil.
Er mwyn gwerthuso patrymau triniaeth glinigol ar gyfer canser y pancreas, fe wnaethom gyfrifo IC50 cyffuriau cemotherapi a ddefnyddir yn gyffredin yn y garfan TCGA-PAAD. Cymharwyd gwahaniaethau mewn crynodiadau ataliol hanner (IC50) rhwng grwpiau risg uchel ac isel gan ddefnyddio prawf Wilcoxon wedi'i lofnodi, a dangosir y canlyniadau fel plotiau bocs a gynhyrchwyd gan ddefnyddio pRRophetic a ggplot2 yn R. Mae pob dull yn cydymffurfio â chanllawiau a normau perthnasol.
Dangosir llif gwaith ein hastudiaeth yn Ffigur 1. Gan ddefnyddio dadansoddiad cydberthynas rhwng lncRNAs a genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd, dewiswyd 724 o irlncRNAs gyda p < 0.01 ac r > 0.4. Nesaf, dadansoddwyd yr lncRNAs a fynegir yn wahaniaethol o GEPIA2 (Ffigur 2A). Mynegwyd cyfanswm o 223 o irlncRNAs yn wahaniaethol rhwng adenocarsinoma pancreatig a meinwe pancreatig arferol (|logFC| > 1, FDR < 0.05), o'r enw DEirlncRNAs.
Adeiladu modelau risg rhagfynegol. (A) Plot llosgfynydd o lncRNAs wedi'u mynegi'n wahaniaethol. (B) Dosbarthiad cyfernodau lasso ar gyfer 20 pâr DEirlncRNA. (C) Amrywiant tebygolrwydd rhannol y dosbarthiad cyfernod LASSO. (D) Plot coedwig yn dangos dadansoddiad atchweliad unnewidyn o 20 pâr DEirlncRNA.
Nesaf, fe wnaethom adeiladu matrics 0 neu 1 trwy baru 223 o DEirlncRNAs. Nodwyd cyfanswm o 13,687 o barau DEirlncRNA. Ar ôl dadansoddiad atchweliad unnewidyn a lasso, profwyd 20 o barau DEirlncRNA yn y pen draw i lunio model risg prognostig (Ffigur 2B-D). Yn seiliedig ar ganlyniadau dadansoddiad atchweliad lasso a lluosog, fe wnaethom gyfrifo sgôr risg ar gyfer pob claf yn y garfan TCGA-PAAD (Tabl 1). Yn seiliedig ar ganlyniadau dadansoddiad atchweliad lasso, fe wnaethom gyfrifo sgôr risg ar gyfer pob claf yn y garfan TCGA-PAAD. Roedd AUC y gromlin ROC yn 0.905 ar gyfer y rhagfynegiad model risg 1 flwyddyn, 0.942 ar gyfer y rhagfynegiad 2 flynedd, a 0.966 ar gyfer y rhagfynegiad 3 blynedd (Ffigur 3A-B). Fe wnaethom osod gwerth torbwynt gorau posibl o 3.105, rhannu cleifion y garfan TCGA-PAAD yn grwpiau risg uchel ac isel, a phlotio'r canlyniadau goroesi a'r dosraniadau sgôr risg ar gyfer pob claf (Ffigur 3C-E). Dangosodd dadansoddiad Kaplan-Meier fod goroesiad cleifion PAAD yn y grŵp risg uchel yn sylweddol is na goroesiad cleifion yn y grŵp risg isel (p < 0.001) (Ffigur 3F).
Dilysrwydd modelau risg prognostig. (A) ROC y model risg prognostig. (B) Modelau risg prognostig ROC 1-, 2-, a 3-blynedd. (C) ROC y model risg prognostig. Yn dangos y pwynt torri gorau posibl. (DE) Dosbarthiad statws goroesi (D) a sgoriau risg (E). (F) Dadansoddiad Kaplan-Meier o gleifion PAAD mewn grwpiau risg uchel ac isel.
Fe wnaethom asesu ymhellach y gwahaniaethau mewn sgoriau risg yn ôl nodweddion clinigol. Mae'r plot stribed (Ffigur 4A) yn dangos y berthynas gyffredinol rhwng nodweddion clinigol a sgoriau risg. Yn benodol, roedd gan gleifion hŷn sgoriau risg uwch (Ffigur 4B). Yn ogystal, roedd gan gleifion â chyfnod II sgoriau risg uwch na chleifion â chyfnod I (Ffigur 4C). O ran gradd tiwmor mewn cleifion PAAD, roedd gan gleifion gradd 3 sgoriau risg uwch na chleifion gradd 1 a 2 (Ffigur 4D). Fe wnaethom gynnal dadansoddiadau atchweliad un-amrywiad ac aml-amrywiad ymhellach a dangos bod sgôr risg (p < 0.001) ac oedran (p = 0.045) yn ffactorau prognostig annibynnol mewn cleifion â PAAD (Ffigur 5A-B). Dangosodd y gromlin ROC fod y sgôr risg yn well na nodweddion clinigol eraill wrth ragweld goroesiad 1-, 2-, a 3-blynedd cleifion â PAAD (Ffigur 5C-E).
Nodweddion clinigol modelau risg prognostig. Mae histogram (A) yn dangos (B) oedran, (C) cam y tiwmor, (D) gradd y tiwmor, sgôr risg, a rhyw cleifion yn y garfan TCGA-PAAD. **p < 0.01
Dadansoddiad rhagfynegol annibynnol o fodelau risg prognostig. (AB) Dadansoddiadau atchweliad unnewidyn (A) ac amlnewidyn (B) o fodelau risg prognostig a nodweddion clinigol. (CE) ROC 1, 2, a 3 blynedd ar gyfer modelau risg prognostig a nodweddion clinigol
Felly, archwiliwyd y berthynas rhwng sgoriau amser a risg. Canfuom fod sgôr risg mewn cleifion PAAD yn gysylltiedig yn wrthdro â chelloedd T CD8+ a chelloedd NK (Ffigur 6A), sy'n dangos swyddogaeth imiwnedd ataliedig yn y grŵp risg uchel. Aseswyd hefyd y gwahaniaeth mewn ymdreiddiad celloedd imiwnedd rhwng y grwpiau risg uchel ac isel a chanfuwyd yr un canlyniadau (Ffigur 7). Roedd llai o ymdreiddiad celloedd T CD8+ a chelloedd NK yn y grŵp risg uchel. Yn ystod y blynyddoedd diwethaf, defnyddiwyd atalyddion pwynt gwirio imiwnedd (ICIs) yn helaeth wrth drin tiwmorau solet. Fodd bynnag, anaml y mae defnyddio ICIs mewn canser y pancreas wedi bod yn llwyddiannus. Felly, aseswyd mynegiant genynnau pwynt gwirio imiwnedd mewn grwpiau risg uchel ac isel. Canfuom fod CTLA-4 a CD161 (KLRB1) wedi'u gor-fynegi yn y grŵp risg isel (Ffigur 6B-G), sy'n dangos y gallai cleifion PAAD yn y grŵp risg isel fod yn sensitif i ICI.
Dadansoddiad cydberthynas o fodel risg prognostig a threiddiad celloedd imiwnedd. (A) Cydberthynas rhwng model risg prognostig a threiddiad celloedd imiwnedd. (BG) Yn dynodi mynegiant genynnau mewn grwpiau risg uchel ac isel. (HK) Gwerthoedd IC50 ar gyfer cyffuriau gwrthganser penodol mewn grwpiau risg uchel ac isel. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = ddim yn arwyddocaol
Fe wnaethom asesu ymhellach y cysylltiad rhwng sgoriau risg ac asiantau cemotherapi cyffredin yn y garfan TCGA-PAAD. Fe wnaethom chwilio am gyffuriau gwrthganser a ddefnyddir yn gyffredin mewn canser y pancreas a dadansoddi gwahaniaethau yn eu gwerthoedd IC50 rhwng grwpiau risg uchel ac isel. Dangosodd y canlyniadau fod gwerth IC50 AZD.2281 (olaparib) yn uwch yn y grŵp risg uchel, gan ddangos y gallai cleifion PAAD yn y grŵp risg uchel fod yn gwrthsefyll triniaeth AZD.2281 (Ffigur 6H). Yn ogystal, roedd gwerthoedd IC50 paclitaxel, sorafenib, ac erlotinib yn is yn y grŵp risg uchel (Ffigur 6I-K). Fe wnaethom nodi ymhellach 34 o gyffuriau gwrthganser gyda gwerthoedd IC50 uwch yn y grŵp risg uchel a 34 o gyffuriau gwrthganser gyda gwerthoedd IC50 is yn y grŵp risg uchel (Tabl 2).
Ni ellir gwadu bod lncRNAs, mRNAs, a miRNAs yn bodoli'n eang ac yn chwarae rhan hanfodol yn natblygiad canser. Mae digon o dystiolaeth yn cefnogi rôl bwysig mRNA neu miRNA wrth ragweld goroesiad cyffredinol mewn sawl math o ganser. Yn ddiamau, mae llawer o fodelau risg prognostig hefyd yn seiliedig ar lncRNAs. Er enghraifft, Luo et al. Mae astudiaethau wedi dangos bod LINC01094 yn chwarae rhan allweddol mewn amlhau a metastasis PC, ac mae mynegiant uchel o LINC01094 yn dynodi goroesiad gwael cleifion canser y pancreas [16]. Mae'r astudiaeth a gyflwynwyd gan Lin et al. Mae astudiaethau wedi dangos bod lleihau'r defnydd o lncRNA FLVCR1-AS1 yn gysylltiedig â prognosis gwael mewn cleifion canser y pancreas [17]. Fodd bynnag, mae lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn cael eu trafod yn gymharol llai o ran rhagweld goroesiad cyffredinol cleifion canser. Yn ddiweddar, mae llawer iawn o waith wedi canolbwyntio ar adeiladu modelau risg prognostig i ragweld goroesiad cleifion canser a thrwy hynny addasu dulliau triniaeth [18, 19, 20]. Mae cydnabyddiaeth gynyddol o rôl bwysig ymdreiddiadau imiwnedd wrth gychwyn canser, ei ddatblygiad, ac ymateb i driniaethau fel cemotherapi. Mae nifer o astudiaethau wedi cadarnhau bod celloedd imiwnedd sy'n treiddio i diwmorau yn chwarae rhan hanfodol yn yr ymateb i gemotherapi cytotocsig [21, 22, 23]. Mae microamgylchedd imiwnedd y tiwmor yn ffactor pwysig yng ngoroesiad cleifion tiwmor [24, 25]. Defnyddir imiwnotherapi, yn enwedig therapi ICI, yn helaeth wrth drin tiwmorau solet [26]. Defnyddir genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn helaeth i lunio modelau risg prognostig. Er enghraifft, Su et al. Mae'r model risg prognostig sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn seiliedig ar enynnau sy'n codio protein i ragweld prognosis cleifion canser yr ofari [27]. Mae genynnau nad ydynt yn codio fel lncRNAs hefyd yn addas ar gyfer llunio modelau risg prognostig [28, 29, 30]. Profodd Luo et al bedwar lncRNA sy'n gysylltiedig ag imiwnedd ac adeiladu model rhagfynegol ar gyfer risg canser ceg y groth [31]. Khan et al. Nodwyd cyfanswm o 32 o drawsgrifiadau â mynegiant gwahaniaethol, ac yn seiliedig ar hyn, sefydlwyd model rhagfynegi gyda 5 trawsgrifiad arwyddocaol, a gynigiwyd fel offeryn a argymhellir yn fawr ar gyfer rhagfynegi gwrthodiad acíwt wedi'i brofi gan fiopsi ar ôl trawsblaniad aren [32].
Mae'r rhan fwyaf o'r modelau hyn yn seiliedig ar lefelau mynegiant genynnau, naill ai genynnau sy'n codio protein neu enynnau nad ydynt yn codio. Fodd bynnag, gall yr un genyn gael gwerthoedd mynegiant gwahanol mewn gwahanol genomau, fformatau data ac mewn gwahanol gleifion, gan arwain at amcangyfrifon ansefydlog mewn modelau rhagfynegol. Yn yr astudiaeth hon, fe wnaethom adeiladu model rhesymol gyda dau bâr o lncRNAs, yn annibynnol ar y gwerthoedd mynegiant union.
Yn yr astudiaeth hon, fe wnaethom nodi irlncRNA am y tro cyntaf trwy ddadansoddiad cydberthynas â genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd. Fe wnaethom sgrinio 223 o DEirlncRNAs trwy hybridio ag lncRNAs a fynegir yn wahanol. Yn ail, fe wnaethom adeiladu matrics 0-neu-1 yn seiliedig ar y dull paru DEirlncRNA cyhoeddedig [31]. Yna fe wnaethom gynnal dadansoddiadau atchweliad unnewidyn a lasso i nodi parau DEirlncRNA prognostig ac adeiladu model risg rhagfynegol. Fe wnaethom ddadansoddi ymhellach y cysylltiad rhwng sgoriau risg a nodweddion clinigol mewn cleifion â PAAD. Fe wnaethom ganfod y gall ein model risg prognostig, fel ffactor prognostig annibynnol mewn cleifion PAAD, wahaniaethu'n effeithiol rhwng cleifion gradd uchel a chleifion gradd isel a chleifion gradd uchel a chleifion gradd isel. Yn ogystal, roedd gwerthoedd AUC cromlin ROC y model risg prognostig yn 0.905 ar gyfer y rhagolwg 1 flwyddyn, 0.942 ar gyfer y rhagolwg 2 flynedd, a 0.966 ar gyfer y rhagolwg 3 blynedd.
Adroddodd ymchwilwyr fod cleifion â mewnlifiad celloedd T CD8+ uwch yn fwy sensitif i driniaeth ICI [33]. Gall cynnydd yng nghynnwys celloedd cytotocsig, celloedd NK CD56, celloedd NK a chelloedd T CD8+ ym microamgylchedd imiwnedd y tiwmor fod yn un o'r rhesymau dros yr effaith ataliol tiwmor [34]. Dangosodd astudiaethau blaenorol fod lefelau uwch o CD4(+) T a CD8(+) T sy'n ymlifo i diwmorau yn gysylltiedig yn sylweddol â goroesiad hirach [35]. Mae mewnlifiad celloedd T CD8 gwael, llwyth neoantigen isel, a microamgylchedd tiwmor imiwnosupresitive iawn yn arwain at ddiffyg ymateb i therapi ICI [36]. Gwelsom fod sgôr risg yn gysylltiedig yn negyddol â chelloedd T CD8+ a chelloedd NK, gan ddangos nad yw cleifion â sgoriau risg uchel o reidrwydd yn addas ar gyfer triniaeth ICI a bod ganddynt prognosis gwaeth.
Mae CD161 yn farciwr celloedd lladdwr naturiol (NK). Mae celloedd T wedi'u trawsdwyso gan CD8+CD161+ CAR yn cyfryngu effeithiolrwydd gwrth-diwmor in vivo gwell mewn modelau xenograft adenocarsinoma dwythellol pancreatig HER2+ [37]. Mae atalyddion pwynt gwirio imiwnedd yn targedu protein 4 cysylltiol lymffocytau T cytotocsig (CTLA-4) a llwybrau protein marwolaeth celloedd rhaglenedig 1 (PD-1)/ligand marwolaeth celloedd rhaglenedig 1 (PD-L1) ac mae ganddynt botensial mawr mewn sawl maes. Mae mynegiant CTLA-4 a CD161 (KLRB1) yn is mewn grwpiau risg uchel, sy'n dangos ymhellach nad yw cleifion â sgoriau risg uchel o bosibl yn gymwys ar gyfer triniaeth ICI. [38]
Er mwyn dod o hyd i opsiynau triniaeth sy'n addas ar gyfer cleifion risg uchel, fe wnaethom ddadansoddi amrywiol gyffuriau gwrthganser a chanfod y gallai paclitaxel, sorafenib, ac erlotinib, a ddefnyddir yn helaeth mewn cleifion â PAAD, fod yn addas ar gyfer cleifion risg uchel â PAAD. [33]. Canfu Zhang et al y gall mwtaniadau mewn unrhyw lwybr ymateb i ddifrod DNA (DDR) arwain at prognosis gwael mewn cleifion canser y prostad [39]. Dangosodd treial Olaparib Canser y Pancreas (POLO) fod triniaeth gynnal gydag olaparib yn ymestyn goroesiad di-ddilyniant o'i gymharu â plasebo ar ôl cemotherapi llinell gyntaf yn seiliedig ar blatinwm mewn cleifion ag adenocarsinoma dwythellol pancreatig a mwtaniadau BRCA1/2 llinell germ [40]. Mae hyn yn rhoi optimistiaeth sylweddol y bydd canlyniadau triniaeth yn gwella'n sylweddol yn yr is-grŵp hwn o gleifion. Yn yr astudiaeth hon, roedd gwerth IC50 AZD.2281 (olaparib) yn uwch yn y grŵp risg uchel, gan nodi y gallai cleifion PAAD yn y grŵp risg uchel fod yn gwrthsefyll triniaeth gydag AZD.2281.
Mae'r modelau rhagweld yn yr astudiaeth hon yn cynhyrchu canlyniadau rhagweld da, ond maent yn seiliedig ar ragolygon dadansoddol. Mae sut i gadarnhau'r canlyniadau hyn gyda data clinigol yn gwestiwn pwysig. Mae uwchsonograffeg dyhead nodwydd mân endosgopig (EUS-FNA) wedi dod yn ddull anhepgor ar gyfer diagnosio briwiau pancreatig solet ac all-pancreatig gyda sensitifrwydd o 85% a phenodoldeb o 98% [41]. Mae dyfodiad nodwyddau biopsi nodwydd mân EUS (EUS-FNB) yn seiliedig yn bennaf ar fanteision canfyddedig dros FNA, megis cywirdeb diagnostig uwch, cael samplau sy'n cadw strwythur histolegol, ac felly cynhyrchu meinwe imiwnedd sy'n hanfodol ar gyfer rhai diagnosisau. staenio arbennig [42]. Cadarnhaodd adolygiad systematig o'r llenyddiaeth fod nodwyddau FNB (yn enwedig 22G) yn dangos yr effeithlonrwydd uchaf wrth gynaeafu meinwe o fasau pancreatig [43]. Yn glinigol, dim ond nifer fach o gleifion sy'n gymwys ar gyfer llawdriniaeth radical, ac mae gan y rhan fwyaf o gleifion diwmorau na ellir eu gweithredu ar adeg y diagnosis cychwynnol. Mewn ymarfer clinigol, dim ond cyfran fach o gleifion sy'n addas ar gyfer llawdriniaeth radical oherwydd bod gan y rhan fwyaf o gleifion diwmorau na ellir eu gweithredu ar adeg y diagnosis cychwynnol. Ar ôl cadarnhad patholegol gan EUS-FNB a dulliau eraill, dewisir triniaeth safonol nad yw'n llawfeddygol fel cemotherapi fel arfer. Ein rhaglen ymchwil ddilynol yw profi model prognostig yr astudiaeth hon mewn cohortau llawfeddygol ac nad yw'n llawfeddygol trwy ddadansoddiad ôl-weithredol.
At ei gilydd, sefydlodd ein hastudiaeth fodel risg prognostig newydd yn seiliedig ar irlncRNA wedi'i baru, a ddangosodd werth prognostig addawol mewn cleifion â chanser y pancreas. Gall ein model risg prognostig helpu i wahaniaethu cleifion â PAAD sy'n addas ar gyfer triniaeth feddygol.
Mae'r setiau data a ddefnyddiwyd ac a ddadansoddwyd yn yr astudiaeth gyfredol ar gael gan yr awdur cyfatebol ar gais rhesymol.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Rôl gyfryngol hunan-effeithiolrwydd wrth reoleiddio emosiynol emosiynau negyddol yn ystod pandemig COVID-19: astudiaeth draws-doriadol. Int J Ment Health Nurs [erthygl cyfnodolyn]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, ac eraill. Barn aelodau'r teulu ar wneud penderfyniadau amgen mewn unedau gofal dwys: adolygiad systematig. INT J NURS STUD [erthygl cylchgrawn; adolygiad]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Canser y pancreas. Lancet. [Erthygl cyfnodolyn; cefnogaeth ymchwil, NIH, allanol; cefnogaeth ymchwil, llywodraeth y tu allan i'r Unol Daleithiau; adolygiad]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemioleg canser y pancreas. Cylchgrawn Byd-eang Gastroenteroleg. [Erthygl cyfnodolyn, adolygiad]. 2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomogram newydd sy'n gysylltiedig â tp53 ar gyfer rhagweld goroesiad cyffredinol mewn cleifion â chanser y pancreas. BMC Cancer [erthygl cyfnodolyn]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Effaith therapi sy'n canolbwyntio ar atebion ar flinder sy'n gysylltiedig â chanser mewn cleifion canser y colon a'r rectwm sy'n derbyn cemotherapi: treial rheoledig ar hap. Nyrs canser. [Erthygl cyfnodolyn; treial rheoledig ar hap; cefnogir yr astudiaeth gan lywodraeth y tu allan i'r Unol Daleithiau]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, ac eraill. Mae lefelau antigen carcinoembryonig (CEA) ôl-lawfeddygol yn rhagweld canlyniad ar ôl tynnu canser y colon a'r rhefrwm mewn cleifion â lefelau CEA cyn-lawfeddygol arferol. Canolfan Ymchwil Canser Cyfieithiadol. [Erthygl cyfnodolyn]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, ac eraill. Mae lncRNA sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn cynhyrchu llofnodion newydd ac yn rhagweld tirwedd imiwnedd carsinoma hepatocellwlaidd dynol. Asidau niwcleig Mol Ther [Erthygl cyfnodolyn]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Imiwnotherapi ar gyfer canser y pancreas: rhwystrau a datblygiadau arloesol. Ann Gastrointestinal Surgeon [Erthygl mewn cyfnodolyn; adolygiad]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNA hir nad ydynt yn codio (LncRNAs), genomeg tiwmor firaol a digwyddiadau ysbeilio annormal: goblygiadau therapiwtig. AM J CANCER RES [erthygl cyfnodolyn; adolygiad]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Adnabod llofnodion lncRNA sy'n gysylltiedig â phrognosis canser endometriaidd. Cyflawniadau gwyddoniaeth [erthygl cylchgrawn]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, ac eraill. Dadansoddiad cynhwysfawr o enynnau prognostig protein sy'n rhwymo RNA ac ymgeiswyr cyffuriau mewn carsinoma celloedd arennol celloedd papilari. pregen. [Erthygl cyfnodolyn]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, ac eraill. Nodweddion RNA hir nad yw'n codio sy'n gysylltiedig ag awtoffagiaeth yn rhagweld prognosis canser y fron. pregen. [Erthygl cyfnodolyn]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Mae llofnod chwe lncRNA sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn gwella prognosis mewn glioblastoma multiforme. MOL Neurobiology. [Erthygl cyfnodolyn]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, ac eraill. Mae llofnod tri-lncRNA newydd yn rhagweld goroesiad cleifion â chanser y pancreas. REPRESENTATIVES OF ONKOL. [Erthygl cyfnodolyn]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. Mae LINC01094 yn hyrwyddo dilyniant canser y pancreas trwy reoleiddio mynegiant LIN28B a'r llwybr PI3K/AKT trwy miR-577 wedi'i sbwngio. Mol Therapeutics – Asidau niwcleig. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, ac eraill. Gall adborth cadarnhaol rhwng lncRNA FLVCR1-AS1 a KLF10 atal dilyniant canser y pancreas trwy'r llwybr PTEN/AKT. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Adnabod tair genyn ar ddeg sy'n rhagweld goroesiad cyffredinol mewn carsinoma hepatocellwlaidd. Biosci Rep [erthygl cyfnodolyn]. 2021 04/09/2021.
Amser postio: Medi-22-2023