Canser y pancreas yw un o'r tiwmorau mwyaf marwol yn y byd gyda phrognosis gwael.Felly, mae angen model rhagfynegi cywir i nodi cleifion sydd â risg uchel o ganser y pancreas i deilwra triniaeth a gwella prognosis y cleifion hyn.
Cawsom ddata RNAseq adenocarcinoma pancreatig Atlas Genom Canser (TCGA) o gronfa ddata Xena UCSC, nodwyd lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwn (irlncRNAs) trwy ddadansoddi cydberthynas, a nodwyd gwahaniaethau rhwng TCGA a meinweoedd adenocarcinoma pancreatig arferol.DEirlncRNA) o TCGA a mynegiant meinwe genoteip (GTEx) meinwe pancreatig.Perfformiwyd dadansoddiadau atchweliad univariate a lasso pellach i adeiladu modelau llofnod prognostig.Yna fe wnaethom gyfrifo'r ardal o dan y gromlin a phennu'r gwerth terfyn gorau posibl ar gyfer nodi cleifion ag adenocarsinoma pancreatig risg uchel ac isel.Cymharu nodweddion clinigol, ymdreiddiad celloedd imiwnedd, micro-amgylchedd gwrthimiwnedd, ac ymwrthedd i gemotherapi mewn cleifion â chanser y pancreas risg uchel ac isel.
Gwnaethom nodi 20 pâr DEirlncRNA a grwpio cleifion yn ôl y gwerth terfyn gorau posibl.Gwnaethom ddangos bod gan ein model llofnod prognostig berfformiad sylweddol o ran rhagweld prognosis cleifion â PAAD.AUC y gromlin ROC yw 0.905 ar gyfer y rhagolwg 1 flwyddyn, 0.942 ar gyfer y rhagolwg 2 flynedd, a 0.966 ar gyfer y rhagolwg 3 blynedd.Roedd gan gleifion risg uchel gyfraddau goroesi is a nodweddion clinigol gwaeth.Fe wnaethom hefyd ddangos bod cleifion risg uchel yn cael eu himiwneiddio a gallant ddatblygu ymwrthedd i imiwnotherapi.Gall gwerthusiad o gyffuriau gwrthganser fel paclitaxel, sorafenib, ac erlotinib yn seiliedig ar offer rhagfynegi cyfrifiannol fod yn briodol ar gyfer cleifion risg uchel â PAAD.
Yn gyffredinol, sefydlodd ein hastudiaeth fodel risg prognostig newydd yn seiliedig ar irlncRNA pâr, a ddangosodd werth prognostig addawol mewn cleifion â chanser y pancreas.Gall ein model risg prognostig helpu i wahaniaethu rhwng cleifion â PAAD sy'n addas ar gyfer triniaeth feddygol.
Mae canser y pancreas yn diwmor malaen gyda chyfradd goroesi pum mlynedd isel a gradd uchel.Ar adeg y diagnosis, mae'r rhan fwyaf o gleifion eisoes mewn camau datblygedig.Yng nghyd-destun yr epidemig COVID-19, mae meddygon a nyrsys o dan bwysau aruthrol wrth drin cleifion â chanser y pancreas, ac mae teuluoedd cleifion hefyd yn wynebu pwysau lluosog wrth wneud penderfyniadau triniaeth [1, 2].Er bod datblygiadau mawr wedi'u gwneud wrth drin DOADs, megis therapi neoadjuvant, echdoriad llawfeddygol, therapi ymbelydredd, cemotherapi, therapi moleciwlaidd wedi'i dargedu, ac atalyddion pwynt gwirio imiwnedd (ICIs), dim ond tua 9% o gleifion sy'n goroesi bum mlynedd ar ôl diagnosis [3 ].], 4].Oherwydd bod symptomau cynnar adenocarcinoma pancreatig yn annodweddiadol, mae cleifion fel arfer yn cael diagnosis o fetastasis ar gam datblygedig [5].Felly, ar gyfer claf penodol, rhaid i driniaeth gynhwysfawr unigol bwyso a mesur manteision ac anfanteision pob opsiwn triniaeth, nid yn unig i ymestyn goroesiad, ond hefyd i wella ansawdd bywyd [6].Felly, mae angen model rhagfynegi effeithiol i asesu prognosis claf yn gywir [7].Felly, gellir dewis triniaeth briodol i gydbwyso goroesiad ac ansawdd bywyd cleifion â PAAD.
Mae prognosis gwael PAAD yn bennaf oherwydd ymwrthedd i gyffuriau cemotherapi.Yn ystod y blynyddoedd diwethaf, mae atalyddion pwynt gwirio imiwnedd wedi'u defnyddio'n helaeth wrth drin tiwmorau solet [8].Fodd bynnag, anaml y bydd y defnydd o ICIs mewn canser pancreatig yn llwyddiannus [9].Felly, mae'n bwysig nodi cleifion a allai elwa o therapi ICI.
Mae RNA di-godio hir (lncRNA) yn fath o RNA di-godio gyda thrawsgrifiadau >200 niwcleotidau.Mae LncRNAs yn eang ac yn cyfrif am tua 80% o'r trawsgrifiad dynol [10].Mae corff mawr o waith wedi dangos y gall modelau prognostig sy'n seiliedig ar lncRNA ragfynegi prognosis cleifion yn effeithiol [11, 12].Er enghraifft, nodwyd 18 lncRNAs cysylltiedig â awtoffagy i gynhyrchu llofnodion prognostig mewn canser y fron [13].Mae chwe lncRNAs arall sy'n gysylltiedig ag imiwn wedi'u defnyddio i sefydlu nodweddion prognostig glioma [14].
Mewn canser y pancreas, mae rhai astudiaethau wedi sefydlu llofnodion yn seiliedig ar lncRNA i ragfynegi prognosis cleifion.Sefydlwyd llofnod 3-lncRNA mewn adenocarcinoma pancreatig gydag ardal o dan y gromlin ROC (AUC) o ddim ond 0.742 a goroesiad cyffredinol (OS) o 3 blynedd [15].Yn ogystal, mae gwerthoedd mynegiant lncRNA yn amrywio ymhlith gwahanol genomau, gwahanol fformatau data, a gwahanol gleifion, ac mae perfformiad y model rhagfynegol yn ansefydlog.Felly, rydym yn defnyddio algorithm modelu newydd, paru ac iteriad, i gynhyrchu llofnodion lncRNA (irlncRNA) sy'n gysylltiedig ag imiwnedd i greu model rhagfynegol mwy cywir a sefydlog [8].
Cafwyd data RNAseq wedi'i normaleiddio (FPKM) a data TCGA canser pancreatig clinigol a mynegiant meinwe genoteip (GTEx) o gronfa ddata XENA UCSC ( https://xenabrowser.net/datapages/ ).Cafwyd ffeiliau GTF o gronfa ddata Ensembl ( http://asia.ensembl.org ) a'u defnyddio i dynnu proffiliau mynegiant lncRNA o RNAseq.Fe wnaethom lawrlwytho genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd o gronfa ddata ImmPort (http://www.immport.org) a nodi lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwnedd (irlncRNAs) gan ddefnyddio dadansoddiad cydberthynas (p <0.001, r> 0.4).Nodi irlncRNAs a fynegir yn wahaniaethol (DEirlncRNAs) trwy groesi irlncRNAs a lncRNAs wedi'u mynegi'n wahaniaethol a gafwyd o gronfa ddata GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) yn y garfan TCGA-PAAD (| logFC | > 1 a FDR ) <0.05) .
Adroddwyd yn flaenorol ar y dull hwn [8].Yn benodol, rydym yn adeiladu X i ddisodli'r lncRNA pâr A a lncRNA B. Pan fydd gwerth mynegiant lncRNA A yn uwch na gwerth mynegiant lncRNA B, diffinnir X fel 1, fel arall diffinnir X fel 0. Felly, gallwn gael gafael ar matrics o 0 neu – 1. Mae echelin fertigol y matrics yn cynrychioli pob sampl, ac mae'r echelin lorweddol yn cynrychioli pob pâr DEirlncRNA gyda gwerth o 0 neu 1.
Defnyddiwyd dadansoddiad atchweliad unnewidyn ac yna atchweliad Lasso i sgrinio parau DEirlncRNA prognostig.Defnyddiodd y dadansoddiad atchweliad lasso groes-ddilysiad 10-plyg wedi'i ailadrodd 1000 o weithiau (p < 0.05), gyda 1000 o ysgogiadau ar hap fesul rhediad.Pan aeth amlder pob pâr DEirlncRNA yn fwy na 100 gwaith mewn 1000 o gylchoedd, dewiswyd parau DEirlncRNA i adeiladu model risg prognostig.Yna fe wnaethom ddefnyddio cromlin AUC i ddod o hyd i'r gwerth terfyn gorau posibl ar gyfer dosbarthu cleifion PAAD yn grwpiau risg uchel ac isel.Cafodd gwerth AUC pob model hefyd ei gyfrifo a'i blotio fel cromlin.Os yw'r gromlin yn cyrraedd y pwynt uchaf gan nodi'r gwerth AUC uchaf, mae'r broses gyfrifo yn dod i ben ac ystyrir mai'r model yw'r ymgeisydd gorau.Adeiladwyd modelau cromlin ROC 1-, 3 a 5 mlynedd.Defnyddiwyd dadansoddiadau atchweliad unnewidyn ac aml-amrywedd i archwilio perfformiad rhagfynegol annibynnol y model risg prognostig.
Defnyddiwch saith teclyn i astudio cyfraddau ymdreiddiad celloedd imiwnedd, gan gynnwys XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, a CIBERSORT.Lawrlwythwyd data ymdreiddiad celloedd imiwnedd o gronfa ddata TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Dadansoddwyd y gwahaniaeth yng nghynnwys celloedd sy'n ymdreiddio imiwn rhwng grwpiau risg uchel ac isel y model adeiledig gan ddefnyddio prawf rheng arwydd Wilcoxon, dangosir y canlyniadau yn y graff sgwâr.Perfformiwyd dadansoddiad cydberthynas Spearman i ddadansoddi'r berthynas rhwng gwerthoedd sgôr risg a chelloedd sy'n ymdreiddio imiwn.Dangosir y cyfernod cydberthynas canlyniadol fel lolipop.Gosodwyd y trothwy arwyddocâd ar p < 0.05.Perfformiwyd y driniaeth gan ddefnyddio'r pecyn R ggplot2.Er mwyn archwilio'r berthynas rhwng y model a'r lefelau mynegiant genynnau sy'n gysylltiedig â'r gyfradd ymdreiddiad celloedd imiwn, fe wnaethom berfformio'r pecyn ggstatsplo a delweddu plot ffidil.
Er mwyn gwerthuso patrymau triniaeth glinigol ar gyfer canser y pancreas, fe wnaethom gyfrifo'r IC50 o gyffuriau cemotherapi a ddefnyddir yn gyffredin yn y garfan TCGA-PAAD.Cymharwyd gwahaniaethau mewn hanner crynodiadau ataliol (IC50) rhwng grwpiau risg uchel ac isel gan ddefnyddio prawf rheng wedi'i lofnodi Wilcoxon, a dangosir y canlyniadau fel blychau blychau a gynhyrchwyd gan ddefnyddio pRRophetic a ggplot2 yn R. Mae'r holl ddulliau'n cydymffurfio â chanllawiau a normau perthnasol.
Dangosir llif gwaith ein hastudiaeth yn Ffigur 1. Gan ddefnyddio dadansoddiad cydberthynas rhwng lncRNAs a genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd, dewisom 724 irlncRNAs gyda p < 0.01 a r > 0.4.Nesaf, fe wnaethom ddadansoddi'r lncRNAs a fynegwyd yn wahaniaethol o GEPIA2 (Ffigur 2A).Mynegwyd cyfanswm o 223 irlncRNAs yn wahaniaethol rhwng adenocarcinoma pancreatig a meinwe pancreatig arferol (| logFC |> 1, FDR < 0.05), a enwir DEirlncRNAs.
Adeiladu modelau risg rhagfynegol.(A) Llain llosgfynydd o lncRNAs a fynegwyd yn wahaniaethol.(B) Dosbarthiad cyfernodau lasso ar gyfer 20 pâr DEirlncRNA.(C) Amrywiant rhannol debygol o ddosraniad cyfernod LASSO.(D) Plot coedwig yn dangos dadansoddiad atchweliad unnewidyn o 20 pâr DEirlncRNA.
Nesaf fe wnaethom adeiladu matrics 0 neu 1 trwy baru 223 DEirlncRNAs.Nodwyd cyfanswm o 13,687 o barau DEirlncRNA.Ar ôl dadansoddiad atchweliad univariate a lasso, profwyd 20 pâr DEirlncRNA o'r diwedd i adeiladu model risg prognostig (Ffigur 2B-D).Yn seiliedig ar ganlyniadau Lasso a dadansoddiad atchweliad lluosog, fe wnaethom gyfrifo sgôr risg ar gyfer pob claf yn y garfan TCGA-PAAD (Tabl 1).Yn seiliedig ar ganlyniadau dadansoddiad atchweliad lasso, fe wnaethom gyfrifo sgôr risg ar gyfer pob claf yn y garfan TCGA-PAAD.AUC y gromlin ROC oedd 0.905 ar gyfer y rhagfynegiad model risg 1 flwyddyn, 0.942 ar gyfer y rhagfynegiad 2 flynedd, a 0.966 ar gyfer y rhagfynegiad 3 blynedd (Ffigur 3A-B).Fe wnaethom osod y gwerth terfyn gorau posibl o 3.105, haenu'r cleifion TCGA-PAAD yn grwpiau risg uchel ac isel, a phlotio'r canlyniadau goroesi a'r dosraniadau sgôr risg ar gyfer pob claf (Ffigur 3C-E).Dangosodd dadansoddiad Kaplan-Meier fod goroesiad cleifion PAAD yn y grŵp risg uchel yn sylweddol is na chyfraddau cleifion yn y grŵp risg isel (p <0.001) (Ffigur 3F).
Dilysrwydd modelau risg prognostig.(A) ROC y model risg prognostig.(B) 1-, 2-, a 3-blynedd ROC modelau risg prognostig.(C) ROC o fodel risg prognostig.Yn dangos y pwynt terfyn gorau posibl.(DE) Dosbarthiad statws goroesi (D) a sgoriau risg (E).(F) Dadansoddiad Kaplan-Meier o gleifion PAAD mewn grwpiau risg uchel ac isel.
Fe wnaethom asesu ymhellach wahaniaethau mewn sgorau risg yn ôl nodweddion clinigol.Mae'r llain stribed (Ffigur 4A) yn dangos y berthynas gyffredinol rhwng nodweddion clinigol a sgoriau risg.Yn benodol, roedd gan gleifion hŷn sgoriau risg uwch (Ffigur 4B).Yn ogystal, roedd gan gleifion â cham II sgoriau risg uwch na chleifion â cham I (Ffigur 4C).O ran gradd tiwmor mewn cleifion PAAD, roedd gan gleifion gradd 3 sgoriau risg uwch na chleifion gradd 1 a 2 (Ffigur 4D).Fe wnaethom berfformio dadansoddiadau atchweliad unnewidyn ac aml-amrywedd ymhellach a dangos bod sgôr risg (p <0.001) ac oedran (p = 0.045) yn ffactorau prognostig annibynnol mewn cleifion â PAAD (Ffigur 5A-B).Dangosodd y gromlin ROC fod y sgôr risg yn well na nodweddion clinigol eraill wrth ragweld goroesiad 1-, 2-, a 3 blynedd cleifion â PAAD (Ffigur 5C-E).
Nodweddion clinigol modelau risg prognostig.Mae histogram (A) yn dangos (B) oedran, (C) cam tiwmor, (D) gradd tiwmor, sgôr risg, a rhyw cleifion yn y garfan TCGA-PAAD.**p < 0.01
Dadansoddiad rhagfynegol annibynnol o fodelau risg prognostig.(AB) Dadansoddiadau atchweliad Univariate (A) ac aml-amrywedd (B) o fodelau risg prognostig a nodweddion clinigol.(CE) ROC 1-, 2-, a 3 blynedd ar gyfer modelau risg prognostig a nodweddion clinigol
Felly, archwiliwyd y berthynas rhwng amser a sgoriau risg.Canfuom fod sgôr risg mewn cleifion PAAD yn cydberthyn yn wrthdro â chelloedd CD8+ T a chelloedd NK (Ffigur 6A), gan nodi swyddogaeth imiwnedd wedi'i hatal yn y grŵp risg uchel.Fe wnaethom hefyd asesu'r gwahaniaeth mewn ymdreiddiad celloedd imiwnedd rhwng y grwpiau risg uchel ac isel a chanfod yr un canlyniadau (Ffigur 7).Roedd llai o ymdreiddiad o gelloedd CD8+ T a chelloedd NK yn y grŵp risg uchel.Yn ystod y blynyddoedd diwethaf, mae atalyddion pwynt gwirio imiwnedd (ICI) wedi cael eu defnyddio'n helaeth wrth drin tiwmorau solet.Fodd bynnag, anaml y bu'r defnydd o ICIs mewn canser pancreatig yn llwyddiannus.Felly, fe wnaethom asesu mynegiant genynnau pwynt gwirio imiwnedd mewn grwpiau risg uchel ac isel.Canfuom fod CTLA-4 a CD161 (KLRB1) wedi'u gorfynegi yn y grŵp risg isel (Ffigur 6B-G), sy'n nodi y gallai cleifion PAAD yn y grŵp risg isel fod yn sensitif i ICI.
Dadansoddiad cydberthynas o fodel risg prognostig ac ymdreiddiad celloedd imiwn.(A) Cydberthynas rhwng model risg prognostig ac ymdreiddiad celloedd imiwn.(BG) Yn dynodi mynegiant genynnau mewn grwpiau risg uchel ac isel.(HK) Gwerthoedd IC50 ar gyfer cyffuriau gwrthganser penodol mewn grwpiau risg uchel ac isel.*p < 0.05, **p < 0.01, ns = ddim yn arwyddocaol
Fe wnaethom asesu ymhellach y cysylltiad rhwng sgorau risg ac asiantau cemotherapi cyffredin yn y garfan TCGA-PAAD.Fe wnaethon ni chwilio am gyffuriau gwrthganser a ddefnyddir yn gyffredin mewn canser pancreatig a dadansoddi gwahaniaethau yn eu gwerthoedd IC50 rhwng grwpiau risg uchel ac isel.Dangosodd y canlyniadau fod gwerth IC50 AZD.2281 (olaparib) yn uwch yn y grŵp risg uchel, gan nodi y gallai cleifion PAAD yn y grŵp risg uchel fod yn gallu gwrthsefyll triniaeth AZD.2281 (Ffigur 6H).Yn ogystal, roedd gwerthoedd IC50 paclitaxel, sorafenib, ac erlotinib yn is yn y grŵp risg uchel (Ffigur 6I-K).Fe wnaethom nodi ymhellach 34 o gyffuriau gwrthganser gyda gwerthoedd IC50 uwch yn y grŵp risg uchel a 34 o gyffuriau gwrthganser gyda gwerthoedd IC50 is yn y grŵp risg uchel (Tabl 2).
Ni ellir gwadu bod lncRNAs, mRNAs, a miRNAs yn bodoli'n eang ac yn chwarae rhan hanfodol yn natblygiad canser.Mae digon o dystiolaeth yn cefnogi rôl bwysig mRNA neu miRNA wrth ragweld goroesiad cyffredinol mewn sawl math o ganser.Yn ddi-os, mae llawer o fodelau risg prognostig hefyd yn seiliedig ar lncRNAs.Er enghraifft, mae Luo et al.Mae astudiaethau wedi dangos bod LINC01094 yn chwarae rhan allweddol mewn amlhau PC a metastasis, ac mae mynegiant uchel o LINC01094 yn nodi goroesiad gwael cleifion canser y pancreas [16].Mae'r astudiaeth a gyflwynwyd gan Lin et al.Mae astudiaethau wedi dangos bod is-reoleiddio lncRNA FLVCR1-AS1 yn gysylltiedig â prognosis gwael mewn cleifion canser pancreatig [17].Fodd bynnag, mae lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn cael eu trafod yn gymharol lai o ran rhagweld goroesiad cyffredinol cleifion canser.Yn ddiweddar, mae llawer iawn o waith wedi'i ganolbwyntio ar adeiladu modelau risg prognostig i ragweld goroesiad cleifion canser a thrwy hynny addasu dulliau triniaeth [18, 19, 20].Mae cydnabyddiaeth gynyddol o rôl bwysig ymdreiddiadau imiwn o ran cychwyn canser, dilyniant, ac ymateb i driniaethau fel cemotherapi.Mae nifer o astudiaethau wedi cadarnhau bod celloedd imiwnedd tiwmor-ymdreiddio yn chwarae rhan hanfodol yn yr ymateb i gemotherapi sytotocsig [21, 22, 23].Mae micro-amgylchedd imiwnedd tiwmor yn ffactor pwysig o ran goroesiad cleifion tiwmor [24, 25].Defnyddir imiwnotherapi, yn enwedig therapi ICI, yn eang wrth drin tiwmorau solet [26].Defnyddir genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn eang i lunio modelau risg prognostig.Er enghraifft, mae Su et al.Mae'r model risg prognostig sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn seiliedig ar enynnau codio protein i ragweld prognosis cleifion canser yr ofari [27].Mae genynnau nad ydynt yn codio fel lncRNAs hefyd yn addas ar gyfer adeiladu modelau risg prognostig [28, 29, 30].Profodd Luo et al bedwar lncRNAs cysylltiedig ag imiwnedd ac adeiladu model rhagfynegol ar gyfer risg canser ceg y groth [31].Mae Khan et al.Nodwyd cyfanswm o 32 o drawsgrifiadau a fynegwyd yn wahaniaethol, ac yn seiliedig ar hyn, sefydlwyd model rhagfynegi gyda 5 trawsgrifiad arwyddocaol, a gynigiwyd fel offeryn a argymhellir yn gryf ar gyfer rhagweld gwrthodiad acíwt a brofwyd gan fiopsi ar ôl trawsblannu aren [32].
Mae'r rhan fwyaf o'r modelau hyn yn seiliedig ar lefelau mynegiant genynnau, naill ai genynnau codio protein neu enynnau nad ydynt yn codio.Fodd bynnag, gall yr un genyn gael gwerthoedd mynegiant gwahanol mewn gwahanol genomau, fformatau data ac mewn gwahanol gleifion, gan arwain at amcangyfrifon ansefydlog mewn modelau rhagfynegol.Yn yr astudiaeth hon, fe wnaethom adeiladu model rhesymol gyda dau bâr o lncRNAs, yn annibynnol ar yr union werthoedd mynegiant.
Yn yr astudiaeth hon, fe wnaethom nodi irlncRNA am y tro cyntaf trwy ddadansoddi cydberthynas â genynnau sy'n gysylltiedig ag imiwnedd.Fe wnaethom sgrinio 223 DEirlncRNAs trwy hybrideiddio â lncRNAs wedi'u mynegi'n wahaniaethol.Yn ail, gwnaethom adeiladu matrics 0-neu-1 yn seiliedig ar y dull paru DEirlncRNA a gyhoeddwyd [31].Yna fe wnaethom gynnal dadansoddiadau atchweliad univariate a lasso i nodi parau DEirlncRNA prognostig ac adeiladu model risg rhagfynegol.Gwnaethom ddadansoddi ymhellach y cysylltiad rhwng sgoriau risg a nodweddion clinigol cleifion â PAAD.Canfuom y gall ein model risg prognostig, fel ffactor prognostig annibynnol mewn cleifion PAAD, wahaniaethu'n effeithiol rhwng cleifion gradd uchel a chleifion gradd isel a chleifion gradd uchel oddi wrth gleifion gradd isel.Yn ogystal, gwerthoedd AUC cromlin ROC y model risg prognostig oedd 0.905 ar gyfer y rhagolwg 1-flynedd, 0.942 ar gyfer y rhagolwg 2 flynedd, a 0.966 ar gyfer y rhagolwg 3 blynedd.
Dywedodd ymchwilwyr fod cleifion ag ymdreiddiad celloedd T CD8 + uwch yn fwy sensitif i driniaeth ICI [33].Gall cynnydd yng nghynnwys celloedd sytotocsig, celloedd CD56 NK, celloedd NK a chelloedd CD8+ T yn y micro-amgylchedd imiwnedd tiwmor fod yn un o'r rhesymau dros effaith atal tiwmor [34].Dangosodd astudiaethau blaenorol fod lefelau uwch o CD4 (+) T a CD8 (+) T sy'n ymdreiddio tiwmor yn gysylltiedig yn sylweddol â goroesiad hirach [35].Arweiniodd ymdreiddiad celloedd CD8 T gwael, llwyth neoantigen isel, a micro-amgylchedd tiwmor gwrthimiwnedd iawn at ddiffyg ymateb i therapi ICI [36].Canfuwyd gennym fod cydberthynas negyddol rhwng sgôr risg a chelloedd CD8+ T a chelloedd NK, gan ddangos efallai na fydd cleifion â sgoriau risg uchel yn addas ar gyfer triniaeth ICI a bod ganddynt ragolygon gwaeth.
Mae CD161 yn farciwr o gelloedd lladdwr naturiol (NK).Mae celloedd T CD8 + CD161+ CAR-transduced cyfryngu gwell effeithiolrwydd antitumor in vivo mewn modelau xenograft adenocarcinoma dwythellol pancreatig HER2 + [37].Mae atalyddion pwynt gwirio imiwnedd yn targedu llwybrau protein sy'n gysylltiedig â lymffocyt T sytotocsig 4 (CTLA-4) a phrotein marwolaeth celloedd 1 (PD-1) / ligand 1 (PD-L1) marwolaeth celloedd wedi'i raglennu ac mae ganddynt botensial mawr mewn llawer o feysydd.Mae mynegiant CTLA-4 a CD161 (KLRB1) yn is mewn grwpiau risg uchel, sy'n dangos ymhellach efallai na fydd cleifion â sgoriau risg uchel yn gymwys i gael triniaeth ICI.[38]
Er mwyn dod o hyd i opsiynau triniaeth sy'n addas ar gyfer cleifion risg uchel, dadansoddom amrywiol gyffuriau gwrth-ganser a chanfod y gallai paclitaxel, sorafenib, ac erlotinib, a ddefnyddir yn eang mewn cleifion â PAAD, fod yn addas ar gyfer cleifion risg uchel â PAAD.[33].Canfu Zhang et al y gall treigladau mewn unrhyw lwybr ymateb difrod DNA (DDR) arwain at brognosis gwael mewn cleifion canser y prostad [39].Dangosodd treial Canser Pancreatig Olaparib Parhaus (POLO) fod triniaeth cynnal a chadw gydag olaparib yn goroesi am gyfnod hir heb ddilyniant o'i gymharu â phlasebo ar ôl cemotherapi llinell gyntaf yn seiliedig ar blatinwm mewn cleifion ag adenocarsinoma dwythellol pancreatig a threigladau germline BRCA1/2 [40].Mae hyn yn rhoi optimistiaeth sylweddol y bydd canlyniadau triniaeth yn gwella'n sylweddol yn yr is-grŵp hwn o gleifion.Yn yr astudiaeth hon, roedd gwerth IC50 AZD.2281 (olaparib) yn uwch yn y grŵp risg uchel, gan nodi y gallai cleifion PAAD yn y grŵp risg uchel fod yn ymwrthol i driniaeth ag AZD.2281.
Mae'r modelau rhagweld yn yr astudiaeth hon yn cynhyrchu canlyniadau rhagweld da, ond maent yn seiliedig ar ragolygon dadansoddol.Mae sut i gadarnhau'r canlyniadau hyn gyda data clinigol yn gwestiwn pwysig.Mae uwchsonograffeg dyhead nodwydd fân endosgopig (EUS-FNA) wedi dod yn ddull anhepgor ar gyfer gwneud diagnosis o friwiau pancreatig solet ac allpancreatig gyda sensitifrwydd o 85% a phenodoldeb o 98% [41].Mae dyfodiad nodwyddau biopsi nodwydd main EUS (EUS-FNB) yn seiliedig yn bennaf ar fanteision canfyddedig dros FNA, megis cywirdeb diagnostig uwch, cael samplau sy'n cadw strwythur histolegol, ac felly'n cynhyrchu meinwe imiwn sy'n hanfodol ar gyfer rhai diagnosisau.staenio arbennig [42].Cadarnhaodd adolygiad systematig o'r llenyddiaeth fod nodwyddau FNB (yn enwedig 22G) yn dangos yr effeithlonrwydd uchaf wrth gynaeafu meinwe o fasau pancreatig [43].Yn glinigol, dim ond nifer fach o gleifion sy'n gymwys i gael llawdriniaeth radical, ac mae gan y rhan fwyaf o gleifion diwmorau anweithredol ar adeg y diagnosis cychwynnol.Mewn ymarfer clinigol, dim ond cyfran fach o gleifion sy'n addas ar gyfer llawdriniaeth radical oherwydd bod gan y rhan fwyaf o gleifion diwmorau anweithredol ar adeg y diagnosis cychwynnol.Ar ôl cadarnhad patholegol gan EUS-FNB a dulliau eraill, dewisir triniaeth safonol nad yw'n llawfeddygol fel cemotherapi fel arfer.Bwriad ein rhaglen ymchwil ddilynol yw profi model prognostig yr astudiaeth hon mewn carfannau llawfeddygol ac anlawfeddygol trwy ddadansoddiad ôl-weithredol.
Yn gyffredinol, sefydlodd ein hastudiaeth fodel risg prognostig newydd yn seiliedig ar irlncRNA pâr, a ddangosodd werth prognostig addawol mewn cleifion â chanser y pancreas.Gall ein model risg prognostig helpu i wahaniaethu rhwng cleifion â PAAD sy'n addas ar gyfer triniaeth feddygol.
Mae'r setiau data a ddefnyddiwyd ac a ddadansoddwyd yn yr astudiaeth gyfredol ar gael gan yr awdur cyfatebol ar gais rhesymol.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Rôl gyfryngu hunan-effeithiolrwydd mewn rheoleiddio emosiynol emosiynau negyddol yn ystod pandemig COVID-19: astudiaeth drawsdoriadol.Int J Nyrsys Iechyd Meddwl [erthygl cyfnodolyn].2021 06/01/2021; 30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al.Barn aelodau'r teulu ar wneud penderfyniadau amgen mewn unedau gofal dwys: adolygiad systematig.INT J STUD NYRS [erthygl cylchgrawn;adolygiad].2023 01/01/2023; 137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Canser y pancreas.Lancet.[Erthygl cyfnodol;cymorth ymchwil, NIH, allanol;cymorth ymchwil, llywodraeth y tu allan i'r Unol Daleithiau;adolygiad].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemioleg canser y pancreas.Cylchgrawn Gastroenteroleg y Byd.[Erthygl cylchgrawn, adolygiad].2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sul S. Nomogram newydd sy'n gysylltiedig â tp53 ar gyfer rhagweld goroesiad cyffredinol mewn cleifion â chanser y pancreas.BMC Cancer [erthygl cyfnodolyn].2021 31-03-2021; 21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Effaith therapi sy'n canolbwyntio ar atebion ar flinder sy'n gysylltiedig â chanser mewn cleifion canser y colon a'r rhefr sy'n cael cemotherapi: treial rheoledig ar hap.Nyrs canser.[Erthygl cyfnodol;hap-dreial rheoledig;cefnogir yr astudiaeth gan lywodraeth y tu allan i'r Unol Daleithiau].2022 05/01/2022; 45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al.Mae lefelau antigen carcinoebryonig ôl-lawdriniaethol (CEA) yn rhagfynegi canlyniad ar ôl echdoriad canser y colon a'r rhefr mewn cleifion â lefelau CEA cyn llawdriniaeth arferol.Canolfan Ymchwil Canser Trosiadol.[Erthygl cyfnodol].2020 01.01.2020; 9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al.Mae lncRNAs sy'n gysylltiedig ag imiwnedd yn cynhyrchu llofnodion newydd ac yn rhagweld tirwedd imiwn carsinoma hepatogellog dynol.‘Ther Asidau niwcleig [Erthygl cylchgrawn].2020 2020-12-04; 22: 937 - 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Imiwnotherapi ar gyfer canser y pancreas: rhwystrau a datblygiadau arloesol.Ann Llawfeddyg Gastroberfeddol [Erthygl Cyfnodolyn;adolygiad].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNAS hir heb godio (LncRNAs), genomeg tiwmor firaol a digwyddiadau splicing aberrant: goblygiadau therapiwtig.AM J CANSER RES [erthygl cyfnodolyn;adolygiad].2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Adnabod llofnodion lncRNA sy'n gysylltiedig â prognosis canser endometrial.Llwyddiannau gwyddoniaeth [erthygl cylchgrawn].2021 2021-01-01; 104(1): 311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al.Dadansoddiad cynhwysfawr o enynnau prognostig protein sy'n rhwymo RNA ac ymgeiswyr cyffuriau mewn carcinoma celloedd arennol celloedd papilari.pregen.[Erthygl cyfnodol].2021 01/20/2021; 12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al.Mae nodweddion RNA di-godio hir sy'n gysylltiedig ag awtophagi yn rhagweld prognosis canser y fron.pregen.[Erthygl cyfnodol].2021 01/20/2021; 12:569318 .
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sul J. Imiwnedd sy'n gysylltiedig â chwe lncRNA llofnod yn gwella prognosis yn glioblastoma multiforme.MOL Niwrobioleg.[Erthygl cyfnodol].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Cân Z, et al.Mae llofnod tri-lncRNA newydd yn rhagweld goroesiad cleifion â chanser y pancreas.CYNRYCHIOLWYR ONKOL.[Erthygl cyfnodol].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Mae Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 yn hyrwyddo dilyniant canser y pancreas trwy reoleiddio mynegiant LIN28B a'r llwybr PI3K/AKT trwy sbwng miR-577.Therapiwteg Mol – Asidau niwcleig.2021; 26:523-35.
Mae Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Gall adborth cadarnhaol rhwng lncRNA FLVCR1-AS1 a KLF10 atal dilyniant canser y pancreas trwy'r llwybr PTEN / AKT.J EXP Canser Clin Res.2021; 40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Adnabod tri ar ddeg o enynnau rhagfynegi goroesiad cyffredinol mewn carsinoma hepatocellular.Cynrychiolydd Biosci [erthygl cyfnodolyn].2021 04/09/2021.
Amser post: Medi-22-2023